Scala勉強会のスケジュール
- 日時：毎週水曜日16:00~より90分。
- 場所：東京大学柏キャンパス 総合研究棟 352号室
- 参加：自由。部屋の規模が大きくないので、学外の方で参加希望の方は一度連絡していただけると助かります。
実施記録
- Lesson 0: Scala Quick Start (2012年6月12日)
- サンプルコードをgitで取得
- Scalaコードの実行
- IntelliJのインストール、コードの実行
- ScalaTestによるテストコードの作成とテストの実行
- テストを実行しながら開発(sbt)
- Lesson 1: Scala Collections (2012年6月21日)
- Array, Map, Set, Tuple
- Option
- 要素を連結した文字列の作成(mkString)
- immutable（変更できない）コレクションを使う
- Builderでコレクションを作成する
- コレクション内を探索する (map, foreach, flatMap, reduce, fold)
- 一部の要素を取り出す (filter, collect)
- 要素を並び替える (sort)
- マルチコアでコレクションを並列処理する (parallel collection, par)
- Lesson 2 (2012年6月27日)
- Lesson 3 アルゴリズムとデータ構造 (2012年7月4日)
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Lesson アルゴリズム
- グラフ(連結リスト)とその探索
- BFS, DFS
- 木構造の表現
- 償却計算量
- Lesson
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loan pattern
- 特定の要素を見つける (find, exists)
- クラスとオブジェクト
- object (singleton)
- パラメーターの定義
- 初期化コード
- lazy parameter
- pattern matching
- case class
- alternative constructor
- 変数のスコープ
- Lesson - Trait
- インターフェースの定義
- 実装の共有
- 多重継承時のlinearization
- Lesson : デバッグ手法
- ScalaTestを用いて、コードの挙動を確認する
- Loggerを用いたデバッグ
- timerで、コードの実行時間を計測する
- Traitでfixtureを作成し、テストコードの共通設定を使い回す
- Lesson : 入出力
- ファイルの読み書き
- 文字列の操作
- 正規表現
- 外部プロセスの実行
- Lesson - 字句解析、構文解析
- Combinator parsers
- コマンドライン引数をparseする
- Lesson ゲノム情報処理
- FASTAファイルからゲノム配列情報を取り出す
- BEDファイルから遺伝子データの読み込み
- WIGファイルでエピゲノム情報の管理
- SAM/BAMファイルの読み書き
- DPによるアラインメント (SmithWaterman(-Gotoh), Banded-alignment, Myer)
- suffix arrayの構築 (induced sorting, parallel dc3)
- Lesson グラフの作成
- jfreechart + iTextで、PDFチャートを作成
- ヒストグラム
- line chart
- box chart
- Rscriptを呼び出し、グラフの作成
- Lesson グラフィックス
- Lesson データベース
- データベースの検索
- データベースの更新
- テキスト検索
- Lesson 分散処理
- Akkaのremote actorを使った分散処理
- objectのserialization/deserialization
-
Scalaの文法
- IntelliJのカスタマイズ